В аниме "Низкоуровневый персонаж Томодзаки" зрители знакомятся с главным героем по имени Фумия Томодзаки, старшеклассником, который, будучи одним из лучших игроков в Японии, считает, что жизнь является самой паршивой игрой из всех возможных. Он разочарован отсутствием чётких условий, целей, наград и смысла в реальной жизни по сравнению с игровым миром, где всё это присутствует.

В один момент он знакомится с Аой Хинами, талантливой и опытной игроком, которая предлагает ему помощь в освоении этой сложной "игры" под названием "жизнь". Это предложение выступает как новый вызов для Томодзаки и заставляет его пересмотреть своё отношение к реальной жизни, обнаруживая, что может быть и другие "правила" и "цели", которые он прежде не замечал.

Таким образом, аниме рассматривает тему поиска смысла и целей в реальной жизни через призму игрового мира, а также динамику отношений между героями, их развитие и взаимодействие в этой повседневной "игре".