Академия Хоннодзи — это не школа. Это государство в государстве. Здесь всем заправляет студенческий совет во главе с неприступной Сацуки Кирюин. Она раздаёт приближённым «крайс-униформы» — одежду, вплетённую из особых волокон, которые дают носителю нечеловеческую силу, скорость и способности. Чем выше ранг, тем круче униформа. Двухзвёздочные подчиняются трёхзвёздочным, а те — четвёрке верных генералов Сацуки. Обычные ученики даже не смеют поднять глаза. Город под школой живёт по тем же законам: если тебя выгонят — семья лишится дома .

Рюко Маотой приходит сюда не за знаниями. В руках у неё огромная половинка ножниц — всё, что осталось от отца, убитого этой штукой. Вторая половинка — у убийцы. Рюко уверена: Сацуки знает правду. Но первая же попытка поговорить заканчивается избиением. Её спасает странная находка в подвале сгоревшего дома — школьная форма, которая дышит и говорит .

— Надень меня, — голос звучит прямо в голове. — Я дам тебе силу.

Рюко перебарывает отвращение и стыд, и форма, которую она называет «Сенкецу» (Свежая Кровь), впивается в неё, питаясь её кровью. Теперь они — одно целое. Только так можно тягаться с униформами Сацуки .

Дальше — череда безумных боёв. Каждый из четвёрки генералов Сацуки сильнее предыдущего. Санагияма, зашивший себе глаза, чтобы видеть больше. Инумута, хакер, превратившийся в цифрового призрака. Джакудзурэ с клубными президентами за спиной. Гамагоори, мазохист, который становится сильнее от боли .

Но чем выше Рюко поднимается, тем больше понимает: всё не так просто. Сацуки не злодейка. У неё свой план. Их мать, Рагё Кирюин, глава корпорации «Ревокс», плетёт сеть пострашнее. Оказывается, униформы сделаны из «жизненных волокон» — инопланетной субстанции, которая паразитирует на людях. И когда-нибудь она накроет всю планету, превратив человечество в безвольных марионеток .

Самое страшное открытие ждёт Рюко впереди. Она не просто дочь учёного, создавшего Сенкецу. Она — сестра Сацуки, эксперимент матери, гибрид человека и жизненных волокон, который должен был умереть при рождении. Но выжил. Именно поэтому Сенкецу может с ней говорить. Именно поэтому она единственная, кто способен остановить мать .

Тем временем в игру вступает Нуи Харимэ — жуткая кукла с весёлым голоском, правая рука Рагё. Та самая, что убила отца и носит вторую половинку ножниц. Её улыбка не сходит с лица даже когда ей отрубают руки. Она — ходячий кошмар, который не чувствует боли и не знает пощады .

В финале сходятся все: Рюко и Сацуки против матери, армии жизненных волокон и космического спутника, готового посеять хаос по всей Земле. Сенкецу жертвует собой, чтобы спасти Рюко. Ножницы смыкаются в единый клинок. Академия Хоннодзи уходит под воду, словно её никогда и не было .